Číslo projektu: LUAUS23118
Název projektu: Stabilizace a diverzifikace allopolyploidních druhů se stejnou genomickou skladbou
Poskytovatel: MŠMT
Program: INTER-EXCELLENCE, podprogram INTER-ACTION
Příjemce: ČZU
Partneři projektu: Brigham Young University (BYU), University of Nebraska Omaha (UNO), Botanický ústav AVČR, v.v.i.
Řešitel za ČZU: Mgr. Karol Krak, Ph.D.
Kontaktní osoba a administrace projektu: Ing. Michaela Kopřivová Stejskalová, Ph.D.
Doba řešení: 2023-2026
Rozpočet projektu: 12 303 400 Kč
Rozpočet za ČZU: 8 326 360 Kč
Abstrakt:
Projekt je zaměřen na objasnění evoluční historie a adaptivní variability související s diverzifikací a stabilizací allotetraploidních druhů z okruhu Chenopodium album. Na této modelové skupině plánujeme studovat mechanizmy týkající se vzniku a stability allotetraploidních taxonů s identickou genomickou skladbou: (1) Na základě fylogenomických, populačně genomických a strukturálně genomických analýz provedených pro každý ze subgenomů samostatně, budeme rekonstruovat způsob vzniku allotetraploidů. Cílem je zjistit, jestli dnes rozlišované taxony jsou výsledkem několika nezávislých hybridizací, nebo vznikly diverzifikací z jednoho společného tetraploidního předka. (2) Budeme zjišťovat, jak se podílí dva koexistující subgenomy na diverzifikaci a stabilizaci těchto taxonů. Konkrétně nás bude zajímat, jestli jsou bodové mutace vykazující známky adaptivní evoluce lokalizované na obou subgenomech, nebo se vyskytují s vyšší frekvencí na jednom z nich. (3) Vedle toho budeme u jednotlivých taxonů zjišťovat přítomnost rozsáhlých strukturálních přestaveb chromozomů, jakožto významného speciačního mechanizmu.